Illustration des genetischen Materials innerhalb eines Coronavirus. (Joao Paulo Burini/Moment/Getty Images) Die Ursprungsgeschichte finden für SARS-CoV-2 , Die Coronavirus Die Krankheit, die weltweit für fast 3,9 Millionen Todesfälle verantwortlich ist, wurde größtenteils durch den fehlenden Zugang zu Informationen aus China, wo die Fälle erstmals auftraten, behindert.
Jetzt hat ein Forscher in Seattle gelöschte Dateien aus Google Cloud ausgegraben, die 13 genetische Teilsequenzen für einige der frühesten Fälle von enthüllen COVID 19 in Wuhan berichtete Carl Zimmer für Die New York Times .
Die Sequenzen geben keinen Ausschlag für eine der vielen Theorien über die Entstehung von SARS-CoV-2 – sie legen keinen nahe Der Virus ist aus einem Hochsicherheitslabor durchgesickert in Wuhan, noch deuten sie auf ein natürliches Spillover-Ereignis hin.
Sie bekräftigen jedoch die Annahme, dass das neuartige Coronavirus bereits vor dem ersten großen Ausbruch auf einem Fischmarkt im Umlauf war.
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Um genau zu bestimmen, wie und wo die Virus Wissenschaftler müssen das sogenannte Vorläufervirus finden, von dem alle anderen Stämme abstammen.
Bisher stammen die frühesten Sequenzen hauptsächlich aus Fällen, die auf dem Huanan Seafood Market in Wuhan entnommen wurden, wo zunächst angenommen wurde, dass das neuartige Coronavirus Ende Dezember 2019 erstmals aufgetreten ist.
Die Fälle von Anfang Dezember bis November 2019 hatten jedoch keine Verbindung zum Markt, was darauf hindeutet, dass sie noch ziemlich früh im Jahr waren Pandemie dass das Virus an einer anderen Stelle entstanden ist.
Bei diesen ersten genetischen Sequenzen gab es ein lästiges Problem. Zu den auf dem Markt gefundenen Fällen gehören drei Mutationen, die in Virusproben von Fällen fehlen, die Wochen später außerhalb des Marktes auftauchten.
Der Viren Das Fehlen dieser drei Mutationen stimmte eher mit dem überein Coronaviren kommt bei Hufeisennasen vor. Wissenschaftler sind sich relativ sicher, dass das neuartige Coronavirus irgendwie aus Fledermäusen hervorgegangen ist, daher ist es logisch anzunehmen, dass dem Vorläufer diese Mutationen ebenfalls fehlen würden.
Und jetzt hat Jesse Bloom vom Howard Hughes Medical Institute in Seattle herausgefunden, dass die gelöschten Sequenzen – wahrscheinlich einige der frühesten Proben – ebenfalls keine Mutationen aufwiesen. (Bloom ist der Hauptautor eines im Mai in der Zeitschrift veröffentlichten Briefes Wissenschaft fordern eine unvoreingenommene Untersuchung der Ursprünge des Coronavirus, Live Science berichtete .)
„Sie sind den Fledermaus-Coronaviren drei Schritte ähnlicher als den Viren vom Huanan-Fischmarkt“, sagte Bloom Die New York Times . Diese neuen Daten deuten darauf hin, dass das Virus schon lange in Wuhan kursierte, bevor es auf dem Fischmarkt auftauchte, sagte Bloom.
„Diese Tatsache legt nahe, dass die Marktsequenzen, die im Mittelpunkt der genomischen Epidemiologie stehen, in… der gemeinsame Bericht der WHO und Chinas … sind nicht repräsentativ für die Viren, die Ende Dezember 2019 und Anfang Januar 2020 in Wuhan kursierten“, schrieb Bloom in seinem Artikel, der am 22. Juni in die Preprint-Datenbank hochgeladen wurde bioRxiv .
Laut Zimmer waren vor etwa einem Jahr 241 genetische Sequenzen von Coronavirus-Patienten aus einer Online-Datenbank namens Sequence Read Archive verschwunden, die von den National Institutes of Health (NIH) verwaltet wird.
Bloom bemerkte die fehlenden Sequenzen, als er auf eine Tabelle in einer im Mai 2020 in der Zeitschrift veröffentlichten Studie stieß PeerJ in dem die Autoren bis Ende März 2020 241 genetische Sequenzen von SARS-CoV-2 auflisten; Die Sequenzen waren Teil eines Projekts der Universität Wuhan mit dem Namen PRJNA612766 und wurden angeblich in das Sequence Read Archive hochgeladen.
Er durchsuchte die Archivdatenbank nach den Sequenzen und erhielt die Meldung „Keine Elemente gefunden“, schrieb Bloom im bioRxiv-Artikel, der nicht von Experten begutachtet wurde.
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Seine Ermittlungen ergaben, dass die gelöschten Sequenzen vom Aisu Fu und Renmin Hospital der Universität Wuhan gesammelt worden waren, und ein Vorabdruck der zu diesen Sequenzen veröffentlichten Forschungsergebnisse (bezeichnet als Wang et al. 2020) deutete darauf hin, dass sie aus Nasenabstrichproben von ambulanten Patienten stammten Verdacht auf COVID-19 zu Beginn des Jahres Epidemie .
Bloom konnte keine Erklärung dafür finden, warum die Sequenzen gelöscht wurden, und seine E-Mails an die beiden entsprechenden Autoren mit der Bitte erhielten keine Antwort.
„Es gibt keinen plausiblen wissenschaftlichen Grund für die Löschung: Die Sequenzen stimmen perfekt mit den in Wang et al. beschriebenen Proben überein.“ (2020a,b)‘, schrieb Bloom in bioRxiv.
„Es gibt keine Korrekturen an dem Papier, das Papier gibt an, dass die Genehmigung menschlicher Probanden eingeholt wurde, und die Sequenzierung zeigt keine Hinweise auf eine Plasmid- oder Probe-zu-Probe-Kontamination.“ Es ist daher wahrscheinlich, dass die Sequenzen gelöscht wurden, um ihre Existenz zu verschleiern.'
Bloom weist auf mehrere Einschränkungen seiner Studie hin, vor allem darauf, dass die Sequenzen nur teilweise sind und keine Informationen enthalten, die ein eindeutiges Datum oder einen eindeutigen Ort der Sammlung angeben würden – Informationen, die für die Rückverfolgung des Virus zu seinem Ursprung von entscheidender Bedeutung sind.
Ungeachtet dessen ist Bloom der Meinung, dass eine genauere Betrachtung der archivierten Daten des NIH und anderer Organisationen – und das Zusammensetzen der Sequenzen – dazu beitragen könnte, ein klareres Bild sowohl des Ursprungs als auch der frühen Ausbreitung von SARS-CoV-2 zu zeichnen, und das alles, ohne dass dafür zusätzliche Informationen benötigt werden. Bodenstudien in China.
Lesen Sie mehr über die gelöschten Sequenzen unter Die New York Times .
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Dieser Artikel wurde ursprünglich veröffentlicht von Live-Wissenschaft . Lesen Sie den Originalartikel Hier .