(NIAID/Wikimedia Commons/CC BY 2.0) 
Island hat alle seine positiven Eigenschaften genetisch sequenziert COVID 19 Fälle seit Beginn der Pandemie , eine immer wichtigere Praxis, da aus Großbritannien und Südafrika besorgniserregende neue Stämme auftauchen.
Der Weltgesundheitsorganisation forderte am Freitag alle Länder auf, die Genomsequenzierung zu intensivieren, um zur Bekämpfung der neu auftretenden Varianten beizutragen.
Wissenschaftler im Labor des isländischen Biopharma-Konzerns deCODE Genetics in Reykjavik haben in den letzten 10 Monaten unermüdlich daran gearbeitet, jedes positive Ergebnis zu analysieren Coronavirus-Test in Island auf Antrag der Gesundheitsbehörden des Landes.
Ziel ist es, jeden Fall nachzuverfolgen, um zu verhindern, dass problematische Fälle durchs Netz gehen.
„Für die eigentliche Sequenzierung benötigen wir relativ wenig Zeit“, erklärt der Leiter des Labors, Olafur Thor Magnusson, und fügt hinzu, dass zur Bestimmung lediglich „ungefähr drei Stunden“ erforderlich seien Virus Beanspruchung.
Der gesamte Prozess, von der Isolierung der DNA bis zur Sequenzierung, kann bis zu anderthalb Tage dauern und hat es Island ermöglicht, 463 verschiedene Varianten zu identifizieren – die Wissenschaftler Haplotypen nennen.
Vor der Sequenzierung wird die DNA jeder Probe zunächst isoliert und dann mithilfe von Magnetkügelchen gereinigt.
Anschließend werden die Proben in einen riesigen, hellen Raum voller Geräte gebracht, wo von kleinen Maschinen, die an Scanner erinnern, ein ohrenbetäubender Lärm erklingt.
Die Maschinen sind Gensequenzierer, die den Roman kartieren Coronavirus Genom.
Weltführer
In jeder Maschine befindet sich eine Blackbox namens „Durchflusszelle“, ein Glasobjektträger, der die DNA-Moleküle enthält.
Diese Technologie spielt in Island seit Beginn der Pandemie eine große Rolle.
„Die Sequenzierung der Proben ist von entscheidender Bedeutung, um uns dabei zu helfen, den Zustand und die Entwicklung zu verfolgen.“ Epidemie „, sagte Gesundheitsminister Svandis Svavarsdottir gegenüber AFP.
Die Behörden hätten die Sequenzierungsinformationen genutzt, um über präzise und gezielte Maßnahmen zur Eindämmung der Ausbreitung des Virus zu entscheiden, sagte sie.
Während die südafrikanische Variante in Island nicht nachgewiesen wurde, wurden 41 Personen als Träger der britischen Variante identifiziert.
Sie alle wurden an der Grenze angehalten, wo PCR-Tests bei Reisenden durchgeführt werden, wodurch die Übertragung der Variante auf der subarktischen Insel wirksam verhindert wurde.
Die DNA-Identifizierung ermöglichte es auch, einen klaren Zusammenhang zwischen Besuchern eines Pubs im Zentrum von Reykjavik und den meisten Infektionen in einer neuen Welle Mitte September herzustellen – was die Behörden dazu veranlasste, Bars und Nachtclubs in der Hauptstadt zu schließen.
Die Sequenzierung identifizierte auch einen separaten Stamm von zwei französischen Touristen, die bei ihrer Ankunft in Island positiv getestet wurden und denen zunächst – fälschlicherweise – vorgeworfen wurde, die Ursache für den Anstieg im September zu sein.
Alle rund 6.000 in Island gemeldeten COVID-19-Fälle wurden sequenziert, womit das Land weltweit führend in der COVID-Sequenzierung ist.
Während mehrere Länder wie Großbritannien, Dänemark, Australien und Neuseeland ein hohes Maß an Sequenzierung durchführen, erreicht keines von ihnen auch nur annähernd das Niveau Islands, obwohl die globalen Statistiken unvollständig sind.
Kinderspiel
Warum ist Island also so weit vorne?
Die Genkartierung ist die Spezialität von deCODE.
Das 1996 gegründete Unternehmen hat die bisher größte genetische Studie einer Population durchgeführt.
Für eine Studie aus dem Jahr 2015 über Krebs Um Risikofaktoren zu identifizieren, sequenzierte es das gesamte Genom von 2.500 Isländern und untersuchte das genetische Profil eines Drittels der damals 330.000 Einwohner zählenden Bevölkerung.
Im Vergleich dazu ist die Sequenzierung von COVID-19-Proben ein Kinderspiel.
„Es ist sehr einfach, dieses virale Genom zu sequenzieren: Es besteht nur aus 30.000 Nukleotiden, es ist nichts“, witzelt Kari Stefansson, die 71-jährige Gründerin und Geschäftsführerin des Unternehmens.
Zum Vergleich: Das menschliche Genom, das normalerweise in seinen Labors analysiert wird, bestehe aus 3,4 Milliarden Nukleotidpaaren oder organischen Molekülen, fügt er hinzu.
Während sich die strenge Sequenzierung in Island für die Verfolgung der Ausbreitung des Virus als nützlich erwiesen hat, hat sie bisher noch nicht zu größeren wissenschaftlichen Entdeckungen für deCODE geführt.
„Wenn es Unterschiede gibt zwischen Viren Bei den verschiedenen Mustermutationen sind sie nicht sehr offensichtlich. „Nicht offensichtlich genug, als dass wir es aufgreifen könnten“, sagt Stefansson.
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